יפן היא קובץ איים המורכב מארבעה חלקים, הוקאידו בצפון מזרח, קר, מושלג בחורף.

הונשו האי המרכזי והגדול ביותר בו נמצאת טוקיו הבירה ורוב הערים הגדולות והמתוירות, יקוקו קרוב לאי המרכזי וקיושו האי הדרום מערבי.
קיימים עוד איים קטנים בריבונות יפנית כמו לדוגמא אוקינאווה בדרום.